Persatuan Pelajar merupakan Organisasi Siswa Intra Sekolah (OSIS) yang dimiliki oleh SMK-SMAK Bogor. Persatuan Pelajar yang lebih dikenal sebagai PP merupakan suatu wadah untuk mengakomodir kegiatan siswa dan sebagai jembatan siswa dengan sekolah, dimana organisasi ini berada dibawah bidang Kesiswaan. Organisasi ini juga merupakan Organisasi RESMI sekolah dan Organisasi siswa tertinggi di sekolah. Kegiatan – kegiatan yang diselenggarakan oleh PP SMAKBO antara lain Studi Banding, SOC (SMAKBO Open Championship) Eksakta, PORSIP (Pekan Olahraga, Seni, dan Ilmu Pengetahuan), Isra’ Mi’raj, Qiyamu Ramadhan, dan Paskal. Selain itu PP juga sering terlibat pada kegiatan sekolah seperti Ekstrakurikuler dan Masa Pengenalan Lingkungan Sekolah (MPLS) untuk siswa baru, Wisuda Sekolah, Penerimaan Peserta Didik Baru, dan lain – lain. Kepengurusan PP sendiri akan berganti setiap tahunnya dan pengurus merupakan perwakilan para siswa terpilih yang ketuanya dipilih dengan cara voting oleh para siswa SMK-SMAK Bogor.

Berikut pengurus inti dan pengurus bidang Persatuan Pelajar SMK-SMAK Bogor Periode 2021/2022:

Staff Bendahara : Fathiyya Maisani R.

Muhammad Jafar Shidiq

Naufal Maulana Irfansyah

Ilham Septian Bakar

Rizka Najla Putri Setiawan

Delia Devina

Shabina Muthia Nanda

Yasmine Hadidjah Syafiyah Rachman